1940年，陈嘉庚代表南洋1000万华侨回国慰问抗战将士，在访问了重庆、西安、延安等地后，于当年11月9日折道到达长汀，视察厦门大学。他踏遍厦大长汀校园的各个角落，高兴地说，“厦大有进步”，“比其他大学可无逊色”。

陈嘉庚和萨本栋一起多方筹措资金，从美国订购了仪器和图书，充实了理工科的实验设备。当时的厦大拥有实验室31间，可容纳600多名学生同时进行实验。扩充了一间图书馆，中外图书超过6万册，中外文杂志超过2万册。

1940年8月，国民政府教育部举行全国性学业竞赛，厦大名列第一；1941年全国专科以上学校学业竞赛，厦大又有6人得奖，在全国最好的5个学校中再居首位，蝉联全国第一。1943年的联合国论文竞赛和福建专科以上学校学生辩论会，厦门大学又获得两个第一名。厦门大学名声大振，东南数省的学子都以能到长汀读厦门大学为荣。时任教育部长的陈立夫对这所最逼近日军占领区的厦大“尤深嘉慰”。

到1945年抗战胜利时，厦大全校发展为4学院15个系，教授、副教授94人，在校生达1044人，是初迁长汀时的5倍。

厦门大学在长汀

萨本栋校长上任以后，一直把提高教学质量放在第一位。他竭力招聘优秀师资，充实教师队伍，1941年厦大51名教授中，有47名来自清华大学。那是个大师云集长汀的时代，不少专家学者、博学鸿儒都曾执教厦大讲坛。

长汀时期，厦门大学的学生总共出了国家科学院和国家工程院院士15人、美国国家工程院院士1人、大学校长6人，海内外著名的专家、学者、教授、企业家数百人。从浩瀚的回忆文章可以看出，他们都把长汀当成第二故乡。这些名人就像天空璀璨的群星，光耀汀州的历史。

1944年8月，萨本栋积劳成疾终于病倒，不得不向教育部提出辞呈，去美国治病。9月，教育部批准萨本栋的辞呈，任命理学院院长汪德耀为国立厦门大学校长。

1945年8月16日，日本军队无条件投降！1946年秋收季节，厦大师生全部返回厦门上课。厦门大学与古汀州的联手戏就此落下帷幕。

可是，他们在困苦中依然“幻想于一条清洁的小河”的诗意，体现出一代纯粹的典型知识分子的浪漫情怀，必将荫泽后代，成为我们的楷模。